Magia w Crono Cross dzieli się na sześć rodzajów, które połączone są dodatkowo w grupy. Tak więc istnieje magia biała i przeciwstawna jej magia czarna. Obok siebie występują magia żółta i zielona, a ostatnie dwie to magia niebieska i czerwona.

Wszytkie postacie korzystają z odpowiedniego rodzaju magii, określonego przez innate postaci. Niektóre z czarów używamy jednokrotnie. Wykorzystany czar kupujemy lub zdobywamy poprzez pułapkę. Korzystanie z pewnych czarów wymaga specjalnych warunków, np. właściwy innate postaci lub field effect.

• innate - czar dla postaci o tym samym innate,
• single - czar jednorazowy,
• summon - summon,

White Magic

Photon Ray

- Level: 1 - Rodzaj: ofensywny - Opis: Promień świetlny trafia w jednego przeciwnika.

Meteorite

- Level: 2 - Rodzaj: ofensywny - Opis: Uderzenie meteorytu w jednego przeciwnika.

Photon Beam

- Level: 3 - Rodzaj: ofensywny - Opis: Silniejszy promień świetlny trafia w jednego przeciwnika.

Meteor Shower

- Level: 4 - Rodzaj: ofensywny - Opis: Uderzenie dwóch meteorytów w przeciwników.

Ultra Light

- Level: 5 - Rodzaj: ofensywny - Opis: Silny atak typu Holy na wszystkich przeciwników.

Ultra Nova innate

- Level: 6 - Rodzaj: ofensywny - Opis: Wielka kula wciąga przeciwników.

Revive

- Level: 1 - Rodzaj: leczący - Opis: Biała kula wskrzesza jednego członka drużyny.

White Out single

- Level: 2 - Rodzaj: leczący - Opis: Usuwa statusy typu White u jednego przeciwnika.

Recover All

- Level: 3 - Rodzaj: leczący - Opis: Odnawia energię wszystkich członków drużyny.

Purify

- Level: 4 - Rodzaj: leczący - Opis: Usuwa wszystkie statusy członków drużyny.

Panacea single

- Level: 4 - Rodzaj: leczący - Opis: Usuwa wszystkie statusy członków drużyny.

Full Revival innate

- Level: 5 - Rodzaj: leczący - Opis: Odnawia całą energię wszystkich członków drużyny.

Holy Healing innate

- Level: 6 - Rodzaj: leczący - Opis: Odnawia całą energię wszystkich członków drużyny i usuwa statusy.

Turn White

- Level: 1 - Rodzaj: wspomagający - Opis: Zmienia typ ataków postaci lub przeciwnika na White.

Anti Black innate

- Level: 3 - Rodzaj: wspomagający - Opis: Tymczasowa blokada elementów typu Black.

Strong Minded

- Level: 4 - Rodzaj: wspomagający - Opis: Tymczasowy wzrost obrony magicznej u jednej postaci.

Weak Minded

- Level: 4 - Rodzaj: wspomagający - Opis: Tymczasowy spadek obrony magicznej u jednego przeciwnika.

Magnify

- Level: 6 - Rodzaj: wspomagający - Opis: Tymczasowy wzrost obrażeń zadawanych przez magię o połowę u wszystkich.

Mag Negate innate

- Level: 6 - Rodzaj: wspomagający - Opis: Tymczasowo anuluje skutki magii u członka drużyny.

Holy Light single

- Level: 5 - Rodzaj: pułapka - Opis: Pozwala złapać czar Holy Light.

Ultra Nova single

- Level: 6 - Rodzaj: pułapka - Opis: Pozwala złapać czar Ultra Nova.

Unicorn single

- Level: 7 - Rodzaj: pułapka - Opis: Pozwala złapać summon Unicorn.

Unicorn innate summon

- Level: 7 - Rodzaj: summon - Opis: Wzrost obrony i obrony magicznej u członków drużyny.

Saints innate summon

- Level: 8 - Rodzaj: summon - Opis: Zadaje duże obrażenia przeciwnikom i leczy członków.

Black Magic

Gravity Blow

- Level: 1 - Rodzaj: ofensywny - Opis: Atak grawitacyjny na jednego przeciwnika.

Hell Soul

- Level: 2 - Rodzaj: ofensywny - Opis: Atak na jednego przeciwnika.

Gravitonne

- Level: 3 - Rodzaj: ofensywny - Opis: Silny atak grawitacyjny na wszystkich przeciwników.

Hell Bound

- Level: 4 - Rodzaj: ofensywny - Opis: Wyssanie energii z przeciwnika.

Free Fall

- Level: 5 - Rodzaj: ofensywny - Opis: Wyrzucenie przeciwnika w powietrze.

Revenge innate

- Level: 5 - Rodzaj: ofensywny - Opis: Przesunięcie anomalii statusu na przeciwnika.

Black Hole

- Level: 6 - Rodzaj: ofensywny - Opis: Atak czarnej dziury na wszystkich przeciwników.

Black Out single

- Level: 2 - Rodzaj: leczący - Opis: Usuwa anomalie statusu typu Black u członka drużyny.

Nostrum single

- Level: 6 - Rodzaj: leczący - Opis: Duża odnowa energii HP u danej postaci z drużyny.

Turn Black

- Level: 1 - Rodzaj: wspomagający - Opis: Zmienia typ ataków postaci lub przeciwnika na Black.

Anti White innate

- Level: 3 - Rodzaj: wspomagający - Opis: Tymczasowa blokada elementów typu White.

Genius

- Level: 4 - Rodzaj: wspomagający - Opis: Tymczasowy wzrost mocy magii danej postaci.

Imbecile

- Level: 4 - Rodzaj: wspomagający - Opis: Tymczasowy spadek mocy magii przeciwnika.

Seal All innate

- Level: 6 - Rodzaj: wspomagający - Opis: Tymczasowe zatrzymanie wszystkich czarów u wszystkich.

Diminish

- Level: 6 - Rodzaj: wspomagający - Opis: Tymczasowe zmniejszenie obrażeń magicznych u wszystkich.

Free Fall single

- Level: 5 - Rodzaj: pułapka - Opis: Pozwala złapać czar Free Fall.

Black Hole single

- Level: 6 - Rodzaj: pułapka - Opis: Pozwala złapać czar Black Hole.

Mother Ship single

- Level: 7 - Rodzaj: pułapka - Opis: Pozwala złapać summon Mother Ship.

Mother Ship innate summon

- Level: 7 - Rodzaj: summon - Opis: Atak UFO na wszystkich przeciwników.

Grim Reaper innate summon

- Level: 8 - Rodzaj: summon - Opis: Atak śmierci.

Yellow Magic

Uplift

- Level: 1 - Rodzaj: ofensywny - Opis: Atak kamieniem na przeciwnika.

Electro Jolt

- Level: 2 - Rodzaj: ofensywny - Opis: Atak elektryczności na przeciwnika.

Upheaval

- Level: 3 - Rodzaj: ofensywny - Opis: Atak odłamków skalnych na przeciwnika.

Electro Bolt

- Level: 4 - Rodzaj: ofensywny - Opis: Atak błyskawicy na przeciwnika.

Earthquake

- Level: 5 - Rodzaj: ofensywny - Opis: Trzęsienie ziemi na wszystkich przeciwników.

Thunda Storm innate

- Level: 6 - Rodzaj: ofensywny - Opis: Burza z piorunami na wszystkich przeciwników.

Brace single

- Level: 1 - Rodzaj: leczący - Opis: Leczy anomalie statusu typu Yellow u członka drużyny.

Capsule single

- Level: 3 - Rodzaj: leczący - Opis: Odnawia część energii członka drużyny.

Turn Yellow

- Level: 1 - Rodzaj: wspomagający - Opis: Zmienia typ ataków postaci lub przeciwnika na Yellow.

Anti Green innate

- Level: 3 - Rodzaj: wspomagający - Opis: Tymczasowa blokada elementów typu Green.

Hi Res

- Level: 4 - Rodzaj: wspomagający - Opis: Tymczasowo zwiększa obronę członka drużyny.

Low Res

- Level: 4 - Rodzaj: wspomagający - Opis: Tymczasowo zmniejsza obronę przeciwnika.

Yellow Field

- Level: 5 - Rodzaj: wspomagający - Opis: Zmienia kolor pola walki na Yellow.

Phys Negate innate

- Level: 6 - Rodzaj: wspomagający - Opis: Tymczasowo anuluje skutki ataków fizycznych u członka drużyny.

Earthquake single

- Level: 5 - Rodzaj: pułapka - Opis: Pozwala złapać czar Earthquake.

Thunda Storm

- Level: 6 - Rodzaj: pułapka - Opis: Pozwala złapać czar Thunda Storm.

Golem single

- Level: 7 - Rodzaj: pułapka - Opis: Pozwala złapać summon Golem.

Golem innate summon

- Level: 7 - Rodzaj: summon - Opis: Miażdżący wszystkich przeciwników atak Golema.

Thunda Snake summon

- Level: 8 - Rodzaj: summon - Opis: Atak wszystkich przeciwników przez elektrycznego węża.

Green Magic

Bushwhacker

- Level: 1 - Rodzaj: ofensywny - Opis: Atak liśćmi na jednego przeciwnika.

Aero Saucer

- Level: 2 - Rodzaj: ofensywny - Opis: Atak ostrzy z powietrza na jednego przeciwnika.

Bushbasher

- Level: 3 - Rodzaj: ofensywny - Opis: Atak korzeni na jednego przeciwnika.

Aero Blaster

- Level: 4 - Rodzaj: ofensywny - Opis: Atak chmury na jednego przeciwnika.

Carnivore

- Level: 5 - Rodzaj: ofensywny - Opis: Atak rośliny na wszystkich przeciwników.

Tornado innate

- Level: 6 - Rodzaj: ofensywny - Opis: Atak tornada na wszystkich przeciwników.

Heal

- Level: 2 - Rodzaj: leczący - Opis: Odnawia mało energii HP danej postaci.

Antidote innate

- Level: 2 - Rodzaj: leczący - Opis: Leczy Poison i anomalie typu Green u danej postaci.

Heal All

- Level: 4 - Rodzaj: leczący - Opis: Odnawia średnią część energii HP u wszystkich z drużyny.

Heal Plus innate

- Level: 6 - Rodzaj: leczący - Opis: Odnawia dużą część energii u członka drużyny.

Turn Green

- Level: 1 - Rodzaj: wspomagający - Opis: Zmienia typ ataków postaci lub przeciwnika na Green.

Anti Yellow innate

- Level: 3 - Rodzaj: wspomagający - Opis: Tymczasowa blokada elementów typu Yellow.

Eagle Eye

- Level: 4 - Rodzaj: wspomagający - Opis: Tymczasowy wzrost celności postaci.

Bat Eye

- Level: 4 - Rodzaj: wspomagający - Opis: Tymczasowy spadek celności przeciwnika.

Green Field

- Level: 5 - Rodzaj: wspomagający - Opis: Zmienia kolor pola walki na Green.

Info Scope innate

- Level: 6 - Rodzaj: wspomagający - Opis: Odkrywa informacje na temat ilości HP przeciwnika.

Carnivore single

- Level: 5 - Rodzaj: pułapka - Opis: Pozwala złapać czar Carnivore.

Tornado single

- Level: 6 - Rodzaj: pułapka - Opis: Pozwala złapać czar Tornado.

Sonja single

- Level: 7 - Rodzaj: pułapka - Opis: Pozwala złapać summon Sonja.

Sonja innate summon

- Level: 7 - Rodzaj: summon - Opis: Trujący pył na wszystkich przeciwników.

Genje innate summon

- Level: 8 - Rodzaj: summon - Opis: Ogromne tornado atakujące wszystkich przeciwników.

Blue Magic

Aqua Beam

- Level: 1 - Rodzaj: ofensywny - Opis: Atak strumienia wody na przeciwnika.

Ice Lance

- Level: 2 - Rodzaj: ofensywny - Opis: Atak lodową włócznią na przeciwnika.

Aqua Ball

- Level: 3 - Rodzaj: ofensywny - Opis: Atak wodnej kuli na wszystkich przeciwników.

Ice Blast

- Level: 4 - Rodzaj: ofensywny - Opis: Atak zamrażający jednego przeciwnika.

Deluge

- Level: 5 - Rodzaj: ofensywny - Opis: Potom zalewający wszystkich przeciwników.

Iceberg innate

- Level: 6 - Rodzaj: ofensywny - Opis: Atak bryły lodu na wszystkich przeciwników.

Cure

- Level: 1 - Rodzaj: leczący - Opis: Odnawia trochę energii HP danej postaci.

Medicine single

- Level: 2 - Rodzaj: leczący - Opis: Leczy anomalie statusu tupu Blue.

Cure Plus

- Level: 3 - Rodzaj: leczący - Opis: Odnawia sporą część energii jednej postaci.

Cure All innate

- Level: 5 - Rodzaj: leczący - Opis: Odnawia dużo energii HP u członków drużyny.

Turn Blue

- Level: 1 - Rodzaj: wspomagający - Opis: Zmienia typ ataków postaci lub przeciwnika na Blue.

Anti Red innate

- Level: 3 - Rodzaj: wspomagający - Opis: Tymczasowa blokada elementów typu Red.

Nimble

- Level: 4 - Rodzaj: wspomagający - Opis: Tymczasowo zwiększa unikanie ataków fizycznych jednej postaci.

Numble

- Level: 4 - Rodzaj: wspomagający - Opis: Tymczasowo zmniejsza unikanie ataków fizycznych u przeciwnika.

Blue Field

- Level: 5 - Rodzaj: wspomagający - Opis: Zmienia kolor pola walki na Blue.

Vigora

- Level: 6 - Rodzaj: wspomagający - Opis: Tymczasowe zatrzymanie spadku staminy u danej postaci.

Deluge single

- Level: 5 - Rodzaj: pułapka - Opis: Pozwala złapać czar Deluge.

Iceberg single

- Level: 6 - Rodzaj: pułapka - Opis: Pozwala złapać czar Iceberg.

Frog Prince single

- Level: 7 - Rodzaj: pułapka - Opis: Pozwala złapać summon Frog Prince.

Frog Prince innate summon

- Level: 7 - Rodzaj: summon - Opis: Atak Księcia Żaby na wszystkich przeciwników.

Blue Whale innate summon

- Level: 8 - Rodzaj: summon - Opis: Atak wielkiego wieloryba na wszystkich przeciwników.

Red Magic

Fireball

- Level: 1 - Rodzaj: ofensywny - Opis: Ataki kuli ognia na jednego przeciwnika.

Magma Bomb

- Level: 2 - Rodzaj: ofensywny - Opis: Atak ogniowy na wszystkich przeciwników.

Fire Pillar

- Level: 3 - Rodzaj: ofensywny - Opis: Słup ognia otacza przeciwnika.

Magma Burst

- Level: 4 - Rodzaj: ofensywny - Opis: Atak lawy na jednego przeciwnika.

Inferno

- Level: 5 - Rodzaj: ofensywny - Opis: Atak wszystkich przeciwników poprzez zwiększenie temperatury.

Volcano innate

- Level: 6 - Rodzaj: ofensywny - Opis: Atak gorącą lawa na wszystkich przeciwników.

Tablet single

- Level: 1 - Rodzaj: leczący - Opis: Odnawia małą część energii HP u jednej postaci.

Ointment single

- Level: 2 - Rodzaj: leczący - Opis: Leczy anomalie statusu typu Red u danej postaci.

Recharge single

- Level: 6 - Rodzaj: leczący - Opis: Odnawia użyty już czar.

Turn Red

- Level: 1 - Rodzaj: wspomagający - Opis: Zmienia typ ataków postaci lub przeciwnika na Red.

Anti Blue innate

- Level: 2 - Rodzaj: wspomagający - Opis: Tymczasowa blokada elementów typu Blue.

Strengthen

- Level: 4 - Rodzaj: wspomagający - Opis: Tymczasowo zwiększa siłę ataku postaci.

Weaken

- Level: 4 - Rodzaj: wspomagający - Opis: Tymczasowo zmniejsza siłę ataku postaci.

Red Field

- Level: 5 - Rodzaj: wspomagający - Opis: Zmienia kolor pola walki na Red.

Nienty Nine

- Level: 6 - Rodzaj: wspomagający - Opis: Tymczasowy wzrost celności postaci do 99%.

Inferno single

- Level: 5 - Rodzaj: pułapka - Opis: Pozwala złapać czar Inferno.

Volcano single

- Level: 6 - Rodzaj: pułapka - Opis: Pozwala złapać czar Volcano.

Red Wolf single

- Level: 7 - Rodzaj: pułapka - Opis: Pozwala złapać summon Red Wolf.

Red Wolf innate summon

- Level: 7 - Rodzaj: summon - Opis: Atak wielkiej fali ognia na wszystkich przeciwników.

Salamander innate summon

- Level: 8 - Rodzaj: summon - Opis: Atak wielkiej kuli ognia na wszystkich przeciwników.