Aya Brea

• Wiek: 25

Aya jest główną bohaterką gry. Jest to młoda, silna, sprytna kobieta posiadająca specjalne zdolności wywołane obecnością mitochondrium w jej ciele. Jest jedyną osobą odporną na  oddziaływanie Eve, a także jedyną osobą, która może ją zatrzymać. Jest bardzo zdeterminowana i ponad wszystko pragnie chronić innych nie  przejmując się swoim bezpieczeństwem.

Maya Brea

• Wiek: ??

Maya była siostrą bliźniaczką głównej bohaterki. Zginęła w wypadku samochodowym gdy była bardzo młoda. Pojawia się kilka razy w grze i  pomaga bohaterce w jej poszukiwaniach, Aya widzi też Mayę w swoich wizjach.

Melissa Pearce

• Wiek: 32

Melissa jest śpiewaczką operową. Jako dziecko brała leki, które miały pomóc jej w walce z chorą nerką, co spowodowało że nie miała zwykłego dzieciństwa jak inni. W końcu jednak udało się uzyskać nerkę dla  Melissy, dawcą stała się dziewczyna mniej więcej w jej wieku, która zginęła w wypadku samochodowym (Maya). Potem jej życie znacznie się poprawiło, nawet leki, które brała nie pozwoliły zapomnieć jej o  marzeniu którym żyła. Kiedy w końcu dostała główną rolę w  przedstawieniu z okazji Świąt Bożego Narodzenia, stało się coś co  odmieniło jej życie, a także życie Aya, mitochondria, które przejęły nad nią kontrolę mają wobec niej inne plany...

Eve

• Wiek: ??

Eve jest ?skutkiem? działania mitochondrium na Melissę. Wszystko staje się jasne w Carnegie Hall gdzie dochodzi do strasznej sytuacji, w  której giną wszyscy widzowie. Melissa nie może całkowicie zapanować nad swoim ciałem, co powoduje jej mutację w istotę zwaną "Mitochondria Eve". Celem Eve jest całkowite uwolnienie mitochondrium. Jest głównym przeciwnikiem w grze.

Daniel Dollis

• Wiek: 42

Daniel jest weteranem w NYPD, jak i partnerem Aya'i, choć ona traktuje go jak ojca. Jego praca polega na patrolowaniu ulic i wyłapywaniu "złych ludzi". Jest po rozwodzie z żoną i wychowuje teraz swojego ośmioletniego syna - Bena.

Ben Dollis

• Wiek: 8

Syn Daniela i Lorraine. Ben jest typowym ośmiolatkiem nie słuchającym się nikogo, ale za to bardzo kocha zwierzęta. Dużo czasu spędza na posterunku gdzie pracuje jego ojciec, najbardziej jednak lubi spędzać czas z K-9, Sheeva.

Kuni Ko-Maeda

• Wiek: 35

Naukowiec, który poświęcił życie na studiowanie wiedzy o  mitochondriach. Jego rolą w grze jest pomóc Aya oraz Danielowi zrozumieć wszystkie niewyjaśnione sprawy dotyczące mitochondrium.

Dr.Hans Klamp

• Wiek: 37

Klamp pracuje w Muzeum, większość czasu spędza przy swoim komputerze, do którego nie chce nas w ogóle dopuścić. Jego rolą w grze jest chęć pomocy Eve, by zaszła w ciąże. Nic więcej o nim nie wiadomo, oprócz tego, że jest zdeterminowany i  nic nie może powstrzymać go od wykonania swojego planu.